据了解,科研团队一共获取了分别来自陕西鱼化寨、杨官寨、安徽尉迟寺、河北小里以及青海喇家等遗址的42例中国黄河流域古代猪高质量的线粒体基因组数据,时间跨度为约7500-2500年前。科研人员研究发现,遗址中出土的部分中国古代猪(25%,可追溯到新石器时代早期)与一些东亚现代的家猪类型一样。这一结果表明它们存在母系遗传的连续性,而且至少可以追溯到新石器时代早期,这一结果支持黄河流域作为一个主要的家猪独立驯化中心。
科研人员还发现古代家猪和现生家猪的线粒体相似度很高,大多数东亚现代家猪分享较近的线粒体基因组类型,并且群体具有很小的遗传距离值,反映出东亚家猪可能来源于一个母系遗传多样性本来就低的祖源群体,也可能与家猪选育的过程有关系。此外,系统进化分枝树的分析支持湄公河流域(包括中国西南地区、越南等地)是东亚大部分家猪群体的祖先群体(野猪群体)的来源地,这一区域可能作为末次冰盛期时的生态庇护所,帮助保留了大量的母系遗传类型,所以在所有家猪和野猪群体中拥有最高的遗传多样性。
科研人员通过古代和现代的线粒体基因组数据进行突变率的推算,发现东亚家猪群体的共同祖先可以追溯到2万年以内。此外,分别开始于大约7000年和4000年前的两次扩增现象也与东亚的气候环境、外来农畜引入及农业社会形成与发展相联系,反映了家猪的母系遗传历史与人类社会发展的紧密联系。
http://www.kepu.gov.cn/www/article/758dd8d6745e489ab101fd2624cd9ac8